当微生物多样性遇上根际土壤微生物,单篇IF高达35。7!

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文章来源:美格基因 发布日期:2021-03-05 21:09

摘要:微生物多样性作为美格基因的热门产品,一直受到老师们的青睐。自产品上线以来,已助力客户发文250余篇,发表期刊涵盖TheISMEJournal、WaterResearch、Microbiome、EnvironmentInternation

微生物多样性作为美格基因的热门产品,一直受到老师们的青睐。自产品上线以来,已助力客户发文250余篇,发表期刊涵盖TheISMEJournal、WaterResearch、Microbiome、EnvironmentInternational、JournalofHazardousMaterials等国际顶尖学术期刊,平均影响因子高达5。53。

根际土壤微生物影响着植物的生长发育,近年来一直是科学家们研究的热点,那当微生物多样性和根际土壤微生物相遇时,又会擦出怎样的火花呢?本期小编将从过往的项目文章中选取几篇具有代表性的佳作分享给各位老师,可不要小看微生物多样性这个发文利器哦,单篇IF竟高达37。5!

1、水稻NRT1。1B基因调控对根系微生物组的影响

水稻NRT1。1B基因调控根系微生物组参与氮利用

题目:NRT1。1Bisassociatedwithrootmicrobiotacompositionandnitrogenuseinfield-grownrice

期刊:NatureBiotechnology

时间:2019。4。29

影响因子:35。7

研究对象与研究策略:细菌16S

样品类型:根际土壤

该项研究揭示了水稻亚种间根系微生物组与其氮肥利用效率的关系,证明了NRT1。1B在调控水稻根系微生物组的关键作用,还建立了第一个水稻根系可培养的细菌资源库,为研究根系微生物组与水稻互作及功能,为应用有益微生物、减少氮肥的施用奠定了基础。

NRT1。1B野生型ZH11和突变体nrt1。1b与水稻根系宏基因组中氨化通路基因差异相关

2、柑橘根际微生物群落结构与功能分析

柑橘根际微生物群落结构与功能分析

题目:Thestructureandfunctionoftheglobalcitrusrhizospheremicrobiome

期刊:NatureCommunications

时间:2018。11。20

影响因子:12。353

研究对象与研究策略:细菌16S、宏基因组

样品类型:根际土壤

该研究运用16S和宏基因组技术,对柑橘根际微生物组的结构和功能组成进行了全面综合的分析,结果显示,根际和非根际样品中丰度高的共有物种只有变形菌门、放线菌门、酸杆菌门和拟杆菌门,它们同样也是其他植物根际的优势物种。柑橘根际微生物在不同的地理环境下的组成结构相似。少数优势物种可以成为未来研究柑橘生产测试的对象。该研究为指导微生物分离和培养,利用微生物组的能力来改善植物生产和健康提供了有价值的参考。

柑橘根际微生物核心功能特征

3、生物炭和植物根系结合对土壤细菌的影响

生物炭和植物根系的结合提高了土壤细菌对多环芳烃胁迫的适应能力:来自土壤酶、微生物组和代谢组的见解

题目:ThecombinationofbiocharandplantrootsimprovessoilbacterialadaptationtoPAHstress:Insightsfromsoilenzymes,microbiome,andmetabolome

期刊:JournalofHazardousMaterials

时间:2020。6。17

影响因子:7。65

研究对象与研究策略:细菌16S、代谢组

样品类型:根际土壤

在这里,通过耦合酶活性测试,高通量测序和土壤代谢组学分析了生物炭和根际对细菌群落结构和功能的影响。生物炭和植物根系提高了有效养分和可溶性有机碳的含量,酶活性和碳代谢功能。在生物炭和植物根系的共同作用下,主要影响蔗糖和淀粉代谢,降低了土壤代谢产物的多样性。在土壤特性,细菌成员,以及生物炭改良土壤和根际土壤中的代谢产物,有利于细菌抵抗PAH胁迫,从而去除PAH。根据以上结果,我们认为生物炭的施用可以有效地改善根际土壤中的细菌功能,并且我们的结果促进了土壤微生物的发展。PAHs污染土壤的原位修复程序。

本文图片梗概

4、微生物群落与土壤代谢组学研究

生物炭改良土壤中多环芳烃有效根际降解机制的研究:从微生物群落到土壤代谢组学

题目:InsightsintothemechanismsunderlyingefficientRhizodegradationofPAHsinbiochar-amendedsoil:Frommicrobialcommunitiestosoilmetabolomics

期刊:EnvironmentInternational

时间:2020。7。16

影响因子:7。577

研究组学:细菌16S、代谢组

样品类型:根际微生物

该研究作者试图通过将多环芳烃(PAH)的直接降解与土壤碳循环耦合来表征多环芳烃的降解网络。从微生物群落结构和功能到代谢途径,作者揭示了生物炭和根际土壤对多环芳烃降解的调控策略。首先,一些PAH降解物被生物炭和根际富集,它们的结合促进了这些PAH降解物之间的合作。同时,在生物炭和根际的共同作用下,参与PAH上游降解的功能基因大幅上调。其次,在网络中,土壤微生物群落成员与代谢物之间存在较强的共生关系,在生物炭和植物根系的联合作用下,多环芳烃降解的下游碳代谢大大上调,表明土壤微生物组生存良好,有助于多环芳烃的生物降解。综上所述,土壤碳代谢和污染物的直接生物降解都可能受到生物炭和植物根系联合作用的调节,共同促进土壤微生物对PAH的降解。

本文图片梗概

5、根际分泌物和土壤微生物的对植物的影响

根系分泌物驱动土壤微生物对植物生长的养分反馈

题目:Rootexudatesdrivesoilmicrobenutrientfeedbacksinresponsetoplantgrowth

期刊:Plant,Cell&;Environment

时间:2020。10。26

影响因子:6。362

研究对象与研究策略:细菌16S、Geochip

样品类型:根际土壤

本文主要探究了不同生长阶段的拟南芥根系分泌物对土壤速效养分、细菌群落组成和功能的影响,以及受不同根系分泌物影响的土壤对植物生长的反馈作用。作者收集拟南芥植物在缓慢和快速生长阶段的根系分泌物,然后添加至养分枯竭的沙质土壤中。两个阶段的根系分泌物差异显著,且均改变了土壤细菌群落组成,与空白对照相比,两种根系分泌物处理均能激发土壤的功能基因,但两个处理之间功能基因组成相似。与缓慢生长阶段的根系分泌物处理和对照相比,快速生长阶段的根系分泌物诱导较高的养分矿化从而促进植物生长。总之,植物在不同的生长阶段调整其根系分泌物组成、招募特异的根际微生物以满足植物在快速生长的阶段更高的营养需求。因此,作者推测植物通过根部分泌化合物,诱导土壤微生物群落的潜在功能,然后通过调节根系分泌物绝对量与成分,进一步激发快速生长阶段所需的功能。

不同生长时期根系分泌物对土壤中的功能基因的影响

点评

从上面的文献案例便能看出,无论是微生物多样性单组学还是微生物多样性叠加其他组学联合分析研究,微生物多样性在其中都起到举足轻重的作用。微生物多样性包括16S、18S和ITS,通过高通量测序技术能够检测PCR产物的序列变异和丰度信息,分析特定环境下微生物群落的多样性和分布规律,以揭示环境样品中众多的微生物种类及它们之间的相对丰度和进化关系。

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